Tanto infectar como infestar significan 'invadir un organismo y multiplicarse en él', pero infectar se usa con microorganismos, como virus o bacterias, mientras que infestar se emplea con macroparásitos (más grandes), como piojos o garrapatas
Según R.A.E:
infectar
Del fr. infecter, der. de infect 'infectado', y este del lat. infectus, part. pas. de inficĕre 'infectar', 'emponzoñar', 'corromper'; cf. lat. infectāre 'turbar'.
1. tr. Dicho de algunos microorganismos patógenos, como los virus o las bacterias: Invadir un ser vivo y multiplicarse en él.
2. tr. Corromper con malas doctrinas o malos ejemplos. U. t. c. prnl.
3. prnl. Dicho de un ser vivo: Resultar invadido por microorganismos patógenos.
Del lat. infestāre.
1. tr. Dicho de ciertos organismos patógenos: Invadir un ser vivo y multiplicarse en él, como los parásitos en sus hospedadores.
2. tr. Causar daños y estragos con hostilidades y correrías.
3. tr. Dicho de los animales o de las plantas advenedizas: Causar estragos y molestias en los campos cultivados y aun en las casas.
4. tr. Dicho de una gran cantidad de personas o de cosas: Llenar un sitio.
5. prnl. Dicho de un ser vivo: Resultar invadido por organismos patógenos.